The study of biomolecular interactions for the development of therapeutics
Year: 2014
Prof. Ing. Jiří Homola, CSc., DSc.
Collaboration: Faculty of Mathematics and Physics, Charles University in Prague; Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v.v.i.
Pracovníci výzkumného týmu Optické biosenzory studovali biomolekulární interakce významné pro vývoj terapeutik nové generace. Věnovali se studiu vlastností chemicky modifikovaných DNA molekul (tzv. antisensních oligonukleotidů – AO) z hlediska jejich potenciálu pro genouvou terapii. Ukázali, že 2 ze 3 studovaných DNA modifikací zvyšují stabilitu komplexu AO s cílovou RNA molekulou v porovnání s nemodifikovanou DNA. Jedna ze studovaných modifikací navíc zvyšovala enzymatickou aktivitu RNasy H, což je klíčová vlastnost pro vysokou efektivitu potenciálního léčiva.
Obrázek č. 1 - Zobrazení principu metody pro studium aktivity RNasy H pomocí SPR biosenzoru.
Obrázek č. 2 - Ukázky interakčních křivek tvorby duplexu AO s RNA pro AO obsahující různý počet chemických modifikací.
Publikace:
- H. Šípová, T. Špringer, D. Rejman, O. Šimák, M. Petrová, P. Novák, Š. Rosenbergová et al.: 5′-O-Methylphosphonate nucleic acids—new modified DNAs that increase the Escherichia coli RNase H cleavage rate of hybrid duplexes. Nucleic acids research (2014), 42(8), 5378-5389.
